经国家宗教局批准，福建佛学院和闽南佛学院正式开办本科教育，学制4年（学历仅适用于佛教界）。学院性质为高等佛教院校，面向全国招生，办学规模均为360人。其主要任务是培养造就爱国爱教、具有佛教学识、自愿献身佛教事业、并能联系广大佛教信众的全日制佛教教职人员，同时有计划地培训在职僧尼，正确阐释佛教教义教规。